IDENTIFICAZIONE DELLE SPECIE DI SOGLIOLE MEDITERRANEE MEDIANTE PCR E SEQUENZIAMENTO, AL FINE DELL'AMPLIAMENTO DEL DATABASE GENEBANK.
Progetto PRESUPPOSTI: attualmente nell'ordine dei Pleuronectiformes sono raggruppate almeno 500 specie. Nella famiglia Soleidae sono compresi 6 generi con 16 specie presenti nel Mediterraneo. La somiglianza tra le diverse specie di sogliole ne permette la facile sostituzione fraudolenta, inoltre la commercializzazione in filetti freschi o congelati non consente il riconoscimento di specie. Si riscontra infine la mancanza di sequenze di specie mediterranee nei database della GeneBank.
PROCEDURE: reperimento delle specie intere di sogliola presente nel Mediterraneo, identificazione certa delle specie mediante chiavi identificative FAO, estrazione del DNA, amplificazione con primer degenerati specifici per il citocromo B, controllo elettroforetico degli ampliconi, purificazione e sequenziamento del prodotto PCR.
OBIETTIVI: costruzione di una banca dati di sequenze ottenute mediante un protocollo standard, confronto delle omologie con altre specie già codificate, invio sequenze mancanti alla GeneBank per arricchire il database pubblico.
RISULTATI ATTESI: con l'impiego di una coppia di primer degenerata ci attendiamo di amplificare un tratto del DNA mitocondriale per il cyt B con una lunghezza attesa di circa 496 paia di basi, utile per un adeguato sequenziamento. Le sequenze per ogni specie ci forniscono uno strumento utile e preciso per la corretta attribuzione di queste specie per qualsiasi preparazione di sogliola presente sul mercato. Infine dall'analisi di classe sulle sequenze ottenute potremmo verificare la vicinanza genetica delle specie mediterranee considerate.