OTTIMIZZAZIONE DEL PERCORSO DIAGNOSTICO-TERAPEUTICO DEL PAZIENTE AFFETTO DA LEUCEMIA LINFATICA CRONICA BASATA SULL'IDENTIFICAZIONE DI NUOVI MARCATORI BIOLOGICI, MEDIANTE ANALISI GENOMICA GLOBALE CON MICROARRAYS AD ALTA RISOLUZIONE
Progetto Presupposti: La leucemia linfatica cronica a linfociti B (B-LLC) è una sindrome linfoproliferativa dovuta ad espansione clonale di linfociti B. La LLC ha un decorso clinico eterogeneo che ne riflette la variabilità biologica: un punto fondamentale per l’arruolamento dei pazienti nei protocolli terapeutici è rappresentato perciò dalla loro stratificazione, di recente migliorata dall’utilizzo della tecnica FISH (fluorescence in situ hybridization) che ha identificato e definito il valore prognostico di alcune lesioni genetiche, e dallo studio dello stato mutazionale dei geni delle regioni variabili delle immunoglobuline (IGVH), oltre che dall’analisi dell’espressione degli antigeni CD38 e ZAP-70. Le recenti tecniche di analisi del profilo globale di espressione genica, del DNA genomico e di microRNA (miRNA) su microarray potranno fornire importanti informazioni. Dalla combinazione di questi dati sarà possibile un’analisi integrata per l'identificazione di pathway molecolari significativamente deregolati in regioni potenzialmente coinvolte nella patogenesi della LLC e per la migliore valutazione dell’outcome clinico dei pazienti.
Descrizione della ricerca: Lo studio proposto riguarderà un pannello di 200 pazienti selezionati da un database di circa 500 B-LLC alla diagnosi in stadio di Binet A, inclusi in uno studio prospettico multicentrico italiano, caratterizzati per la presenza delle maggiori lesioni genetiche tramite FISH, per lo stato mutazionale dei geni IGHV e l’espressione di CD38 e ZAP-70.
La ricerca si propone i seguenti obiettivi:1) analisi del profilo di espressione genica globale; 2) analisi del profilo del DNA genomico con SNP-microarray; 3) validazione dei risultati ottenuti mediante la metodica FISH; 4) analisi del profilo di espressione di miRNA; 5)integrazione dei dati dei profili di espressione genica e genomici; 6) analisi di correlazione di nuove lesioni genetiche e pathway molecolari identificati con l’andamento clinico, inteso come tempo al primo trattamento.
Obiettivi: Lo scopo principale del nostro studio è approfondire le conoscenze sui meccanismi molecolari coinvolti nella patogenesi della B-LLC con una analisi integrata del genoma e trascrittoma (inclusi i miRNA) nell’ambito di un’ampia casistica di pazienti alla diagnosi in stadio di Binet A, oggi sottoposti a semplice osservazione. L'utilizzo di tecniche estremamente innovative e tecnologicamente avanzate e la loro integrazione tramite approcci informatici e biostatistici, unitamente alla disponibilità delle informazioni relative all’andamento clinico dei pazienti in esame, rappresenta una importante opportunità per attuare una migliore stratificazione molecolare e prognostica della neoplasia, che metta in grado il clinico di individuare quali dei pazienti in stadio iniziale svilupperanno una malattia aggressiva che potrebbe beneficiare di un trattamento terapeutico precoce.