ANALISI DELLA VARIABILITA¿ GENETICA NELLA RAZZA VALDARNESE BIANCA (Gallus gallus) ATTRAVERSO L¿UTILIZZO DI MARCATORI MICROSATELLITI
ProjectLa biodiversità in avicoltura è considerata una delle risorse genetiche maggiormente a rischio a causa della diffusione su scala mondiale di pochi ibridi commerciali altamente produttivi.
La determinazione della variabilità genetica di ciascuna popolazione risulta essere un passaggio fondamentale del processo di valutazione delle razze locali come risorsa genetica. I microsatelliti sono marcatori genetici efficaci nella determinazione dell¿eterozigosità e delle distanze genetiche a livello del DNA. Le informazioni riguardanti le razze avicole Italiane sono molto scarse e le ricerche sul make-up genetico delle stesse ricoprono un ruolo importante nei programmi di conservazione delle popolazioni a rischio fornendo supporti oggettivi di selezione.
Lo scopo del progetto proposto è quello di valutare la variabilità genetica presente nella popolazione di valdarnese bianca attualmente selezionata nella zona di origine della razza.
Il DNA verrà estratto dai campioni ematici raccolti utilizzando procedure standard, tutti i soggetti verranno testati con almeno 8 microsatelliti scelti tra quelli suggeriti nelle liste delle FAO. Il DNA estratto verrà amplificato attraverso PCR e i prodotti verranno separati su gel di poliacrilamide (sequenziatore ABI Prism 377). Verranno calcolate le frequenze alleliche e la deviazione dall¿equilibrio di Hardy-Weinberg. Verranno inoltre calcolate la eterozigosità stimata e attesa (HO HE); verrà quindi eseguita un¿analisi fattoriale della distribuzione tridimensionale. Le distanze genetiche tra differenti popolazioni/centri di selezione verranno quindi calcolate attraverso software dedicati. I risultati ottenuti permetteranno di valutare la variabilità genetica presente nella razza Valdarnese bianca fornendo indicazioni utili sia per la selezione che per la conservazione della razza attraverso la scelta di riproduttori effettuata su base genetica.
La determinazione della variabilità genetica di ciascuna popolazione risulta essere un passaggio fondamentale del processo di valutazione delle razze locali come risorsa genetica. I microsatelliti sono marcatori genetici efficaci nella determinazione dell¿eterozigosità e delle distanze genetiche a livello del DNA. Le informazioni riguardanti le razze avicole Italiane sono molto scarse e le ricerche sul make-up genetico delle stesse ricoprono un ruolo importante nei programmi di conservazione delle popolazioni a rischio fornendo supporti oggettivi di selezione.
Lo scopo del progetto proposto è quello di valutare la variabilità genetica presente nella popolazione di valdarnese bianca attualmente selezionata nella zona di origine della razza.
Il DNA verrà estratto dai campioni ematici raccolti utilizzando procedure standard, tutti i soggetti verranno testati con almeno 8 microsatelliti scelti tra quelli suggeriti nelle liste delle FAO. Il DNA estratto verrà amplificato attraverso PCR e i prodotti verranno separati su gel di poliacrilamide (sequenziatore ABI Prism 377). Verranno calcolate le frequenze alleliche e la deviazione dall¿equilibrio di Hardy-Weinberg. Verranno inoltre calcolate la eterozigosità stimata e attesa (HO HE); verrà quindi eseguita un¿analisi fattoriale della distribuzione tridimensionale. Le distanze genetiche tra differenti popolazioni/centri di selezione verranno quindi calcolate attraverso software dedicati. I risultati ottenuti permetteranno di valutare la variabilità genetica presente nella razza Valdarnese bianca fornendo indicazioni utili sia per la selezione che per la conservazione della razza attraverso la scelta di riproduttori effettuata su base genetica.