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  1. Attività

Simulazione meccanico-statistica dell'interazione acqua-biomolecole

Progetto
Si conta di sviluppare l'attivita' di ricerca secondo le seguenti linee:

a) Studio del comportamento di molecole di acqua in condizioni di confinamento geometrico. Si investigheranno le caratteristiche stereodinamiche dell'acqua intrappolata in una molecola organica recentemente sintetizzata (benzotriborneolo, BTB). Tale composto, che ha una struttura chirale, presenta infatti due cavita', in una delle quali sono presenti tre gruppi ossidrilici che possono agganciare molecole di acqua del solvente. Si valutera' in particolare quante di tali molecole e quanto a lungo sono trattenute nella prima shell di idratazione del BTB. Questo tipo di indagine puo' fornire contributi di rilievo per chiarire dettagli molecolari del comportamento dell'acqua confinata in prossimita' di siti attivi di proteine o in canali biomolecolari transmembrana.

b) Studio della struttura molecolare di un frammento biologicamente attivo di fibronettina. La fibronettina (FN) e' una proteina dimerica (250 kDa), presente nel sangue e nella matrice extracellulare (ECM) di tessuti connettivi, che e' coinvolta in importanti processi biologici: adesione, migrazione, proliferazione e differenziazione cellulari. Essa gioca quindi un ruolo rilevante nella ricostruzione di tessuti e nella crescita e dispersione di tumori. E' stato recentemente provato che anche un piccolo frammento della FN (costituito da 13 aminoacidi) induce l'organizzazione della matrice ECM, ma non cosi' alcune sue varianti artificiali. Si investigheranno le caratteristiche strutturali del 13-mero e delle sue varianti, in connessione con esperimenti genetici e misure CD e NMR. I risultati potrebbero permettere di determinare simulativamente se e quali peptidi di lunghezza minore potrebbero essere biologicamente attivi e di individuarne i relativi peptidi complementari, che in situazioni analoghe si sono dimostrati in grado di esplicare importanti funzioni biologiche in vitro se non addirittura nella sperimentazione clinica.

  • Dati Generali

Dati Generali

Tipo

PUR20062008 - PUR 2006-2008

Periodo di attività

Giugno 26, 2006 -
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