Analisi bioinformatica di ¿pattern¿ di espressione per l'individuazione di biomarker di malattia
Progetto La disponibilità di metodologie bioinformatiche in grado di estrarre in modo efficiente informazione da grosse quantità di dati per la caratterizzazione della funzionalita¿ di un organismo costituisce un supporto di fondamentale importanza per l¿analisi di biomarkers. In particolare, la possibilità di gestire i dati organizzandoli secondo specifici criteri, quali organismo, tessuto, stadio di sviluppo e/o condizioni fisiologiche, ha enormi potenzialità in termini di identificazione di markers per la diagnostica. I biomarker possono essere usati per diagnosi/prognosi di malattie, monitoraggio di tossicità ... E¿ possibile considerare biomarker di differente natura: geni, mRNA, proteine, metabolici, numero di cellule,..... L¿obiettivo è decifrare l¿interconnessione fra geni, proteine e metaboliti al fine di comprendere i processi che determinano condizioni patologiche per sviluppare opportuni sistemi diagnostici e di intervento. Alterazioni molecolari a livello di DNA, RNA, metaboliti o proteine rappresentano infatti sintomi di particolari condizioni di un organismo, oltre a dipendere dallo specifico contesto. Ciò implica la necessità di accrescere le conoscenze circa le funzionalità dei sistemi biologici considerati.
-migliorare le metodologie bioinformatiche per l¿analisi di ¿pattern¿ di espressione in relazione a condizioni fisiologiche o patologiche mediante approcci comparativi, al fine di caratterizzare la risposta dei sistemi in esame in seguito a perturbazioni.
-affrontare la sfida informatica dell¿integrazione e dell¿analisi di biomarker multipli, analizzati mediante approcci multi-livello, in termini di analisi e gestione dei dati, per considerare indicatori più affidabili anche di piu¿ fenomeni.
I dati oggetto delle elaborazioni sono il frutto di progetti di ricerca già finanziati (FIRB -Proteomica del Latte) e COFIN (Ghiandola Mammaria della Bovina) di cui il richiedente è Coordinatore nazionale.