IDENTIFICAZIONE DELLE SPECIE DI SOGLIOLE MEDITERRANEE E IN PARTICOLARE DELLE DIFFERENTI POPOLAZIONI DI SOGLIOLA DEL PORRO MEDIANTE PCR E SEQUENZIAMENTO, AL FINE DELL'AMPLIAMENTO DEL DATABASE DELLA GENEBANK.
Progetto PRESUPPOSTI: il problema della identificazione dei pesci piatti è attuale e da completare dato che attualmente nell'ordine dei Pleuronectiformes sono raggruppate almeno 500 specie. Nella famiglia Soleidae sono compresi 6 generi con 16 specie presenti nel Mediterraneo. In particolare risulta da definire l¿identificazione della sogliola dal porro (Solea lascaris) di cui si conosce la presenza di 3 fenotipi, presenti rispettivamente nel mare adriatico, nell¿Atlantico nord occidentale e nell¿Atlantico sud occidentale. Infatti non è attualmente possibile distinguerle con le comuni tecniche di PCR-sequenziamento.
PROCEDURE: reperimento delle specie intere di sogliola oggetto di studio, identificazione certa delle specie mediante chiavi identificative FAO, estrazione del DNA, amplificazione con primer degenerati specifici per il citocromo B e primers per la long-PCR, controllo elettroforetico degli ampliconi, purificazione e sequenziamento del prodotto PCR.
OBIETTIVI: costruzione di una banca dati di sequenze ottenute mediante un protocollo standard, confronto delle omologie con altre specie già codificate, sequenziameto di tratti di DNA mitocondriale che permettano di documentare l¿eventuale differenza di specie nei differenti fenotipi di sogliola dal porro.
RISULTATI ATTESI: con l'impiego di una coppia di primer degenerata ci attendiamo di amplificare un tratto del DNA mitocondriale per il cyt B con una lunghezza attesa di circa 496 paia di basi, utile per un adeguato sequenziamento. Le sequenze per ogni specie ci forniscono uno strumento utile e preciso per la corretta attribuzione di queste specie per qualsiasi preparazione di sogliola presente sul mercato.
Sequenziamento dell¿intero DNA mitocondriale della sogliola del porro.