Uncovering Novel DNA Repair Protein Functions that Promote Genome Stability by Integrating Multiple DNA Metabolism Pathways
ProjectL’oggetto della ricerca è comprendere come le proteine della ricombinazione omologa come RAD51, BRCA1/2 e altre riconoscano e neutralizzino siti abasici (AP), lesioni endogene del DNA, prevenendo l’accumulo di interruzioni nella doppia elica di DNA e la rottura delle forche replicative.
Le attività previste includono:
a) la ricostituzione biochimica e funzionale delle principali reazioni coinvolte,
b) misure quantitative del legame DNA-proteine,
c) studio della dinamica della formazione dei nucleo-filamenti di RAD51 tramite metodiche biofisiche,
d) determinazione strutturale di complessi di DNA contenenti siti AP e proteine della ricombinazione,
e) microscopia elettronica per visualizzare intermedi di replicazione e riparo,
f) identificazione di nuovi fattori di legame al DNA abasico tramite proteomica,
g) determinazione dell’effetto dei siti AP in cellule umane con saggi di DNA fiber,
h) mappatura genomica dei siti AP e analisi genomiche delle mutazioni da essi indotte.
Le attività previste includono:
a) la ricostituzione biochimica e funzionale delle principali reazioni coinvolte,
b) misure quantitative del legame DNA-proteine,
c) studio della dinamica della formazione dei nucleo-filamenti di RAD51 tramite metodiche biofisiche,
d) determinazione strutturale di complessi di DNA contenenti siti AP e proteine della ricombinazione,
e) microscopia elettronica per visualizzare intermedi di replicazione e riparo,
f) identificazione di nuovi fattori di legame al DNA abasico tramite proteomica,
g) determinazione dell’effetto dei siti AP in cellule umane con saggi di DNA fiber,
h) mappatura genomica dei siti AP e analisi genomiche delle mutazioni da essi indotte.