Si intende proseguire negli studi di tipizzazione molecolare di Lactobacillus helveticus, approfondendo ed ampliando con nuovi approcci scientifici e metodologici i risultati ottenuti nell¿anno precedente. Nel 2005 è stata messa a punto una analisi MLRT (Multi Locus Restriction Typing) (in corso di pubblicazione su rivista internazionale con IF) che è risultata una promettente alternativa per la discriminazione di ceppi strettamente correlati, provenienti da diverse nicchie ecologiche. In quest¿ambito si intende proseguire nello studio della individuazione della variabilità genetica di L. helveticus, ricercando la distribuzione di sequenze di inserzione (IS) lungo il genoma batterico. La presenza di IS, anche in numero di copie elevate, è una scoperta di recente acquisizione e considerata una delle più importanti fonti di variabilità genetica. Obiettivi della futura ricerca saranno: a) caratterizzare in termini molecolari sequenze di inserzioni, con amplificazioni specifiche e tecniche di sequenziamento; b) valutarne la distribuzione lungo il genoma dei ceppi allo studio; c) valutarne la presenza in altre specie di batteri lattici per la possibilità di ottenere nuovi marker genetici specie-specifici. Sempre nel 2005 è stato determinato anche il profilo plasmidico di ceppi di L. helveticus. I risultati ottenuti (oggetto di una pubblicazione su rivista internazionale con IF) hanno messo in evidenza anche in questo caso un ampio grado di variabilità. Preliminari indagini sulla struttura primaria di alcune di queste molecole hanno permesso di individuare la presenza di diversi gruppi di omologia, alcuni di questi non ancora indagati. Obiettivi della futura ricerca saranno: a) sequenziamento completo di alcuni plasmidi, considerati rappresentativi dei diversi gruppi di omologia precedentemente individuati; b) analisi delle sequenze nucleotidiche per la ricerca dei moduli replicativi e di regioni codificanti.