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  1. Projects

Evoluzione delle glutatione trasferasi microsomali (mGST)

Project
Le GST sono un¿antica superfamiglia di proteine multifunzionali, sia catalitiche che non, presente in tutti gli organismi aerobi, principalmente coinvolte nella detossificazione di endo e xenobiotici, nella protezione cellulare dai danni derivati da stress ossidativo e nel metabolismo di leucotrieni e prostglandine.Le GST ricadono in due famiglie distinte: le GST solubili o citosoliche (cGST) e quelle legate a membrane o microsomali (mGST). Le GST citosoliche sono le più numerose e meglio caratterizzate, annoverando decine di membri in tutti gli organismi aerobi. Dal punto di vista evolutivo derivano da un¿ancestrale proteina di legame al glutatione, ma la grande espansione della famiglia è avvenuta indipendentemente nei vari phyla dopo la loro separazione. Invece le GST microsomali sono meno numerose e, con l¿eccezione di quelle di mammifero, assai meno caratterizzate. Le mGST di mammifero appartengono alla famiglia delle proteine MAPEG (Membrane-Associated Proteins in Eicosanoid and Glutathione metabolism), che include anche membri di piante, funghi e batteri. La loro storia evolutiva è ad oggi non chiara: è possibile che condividano ancestori comuni alle cGST o che la loro origine sia del tutto indipendente. Scopo di questo progetto è l¿isolamento e la caratterizzazione delle GST microsomali dal punto di vista evolutivo. A tal fine ci si propone di: 1) Isolare in silico un gran numero di geni codificanti GST microsomali da organismi eucarioti e procarioti, attraverso ricerche BLAST in database di sequenze EST e genomiche, utilizzando le sequenze delle mGST di riso e Arabidopsis da noi recentemente isolate come ¿query¿. 2) Confermare le sequenze isolate tramite verifica della presenza dei tipici domini transmembrana (profili di idrofobicità). 3) Costruire alberi filogenetici (programmi PROTDIST del pacchetto Phylip e MrBayes) a partire da set diversi di sequenze GST: a) GST citosoliche e microsomali; b) tutte le mGST isolate (punti 1 e 2); mGST di piante.
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Academic Signature

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Academic Signature (2)

Glutathione Transferase
Alkyl and Aryl Transferases
Sequence Alignment
Genetic Techniques

Overview

Type

PUR20062008 - PUR 2006-2008

Date/time interval

June 20, 2006 -
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