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  1. Strutture

Dinamica molecolare di un'HDL sintetica contenente apoA-I Milano ed apoA-II in forma eterodimerica

Progetto
L'apoA-I è la principale apolipoproteina componente delle HDL, deputate al trasporto inverso del colesterolo dai tessuti al fegato. L'apoA-I Milano è un mutante R173C che forma omodimeri ed eterodimeri con l'apoA-II, e viene attualmente studiato come farmaco in grado di rimuovere i lipidi dalle placche aterosclerotiche. Almeno tre modelli sono stati proposti per le HDL discoidali, indicati come 'picket-fence', 'double-belt' e 'hairpin'. In tutti i casi, in queste vengono proposte solo minime variazioni strutturali per l'apoA-IM rispetto alla forma wild-type. In realtà le proprietà biologiche, biochimiche e chimico-fisiche variano sensibilmente tra le due apolipoproteine. Infatti le HDL che contengono l'apoA-IM sono più efficienti nel promuovere il trasporto inverso del colesterolo. Noi stessi abbiamo potuto poi dimostrare che la suscettibilità alla proteolisi è maggiore per l'apoA-IM che per il wild-type e che, dopo aver allontanato i lipidi e saturato con un detergente non-ionico, la mobilità elettroforetica dell'apoA-IM è minore. L'insieme di queste informazioni implica che la struttura delle due varianti genetiche debba essere diversa e probabilmente lontana da quanto attualmente si ritiene. L'eterodimero apoA-I - apoA-II è in molti dei portatori la componente proteica più abbondante delle HDL e concorre certamente in modo fondamentale all'azione antiaterogena del mutante. Sono state risolte ai raggi X strutture cristallografiche delle forme lipid-free sia dell'apoA-I sia dell'apoA-II. A partire da queste strutture intendiamo costruire un modello dell¿eterodimero all¿interno di una HDL sintetica costituita da POPC, usando le procedure di bioinformatica e chimica computazionale introdotte nel nostro laboratorio in questi ultimi anni. In particolare condurremo simulazioni di docking molecolare e di dinamica molecolare ed essenziale. Ci aspettiamo che la conoscenza della struttura possa aiutare a comprendere comportamento e meccanismo di attività dell'apoA-IM.
  • Academic Signature
  • Dati Generali

Academic Signature

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Academic Signature (12)

Apolipoprotein A-I
Apolipoproteins A
Apolipoprotein A-II
Apolipoproteins A
Proteolysis
Biochemical Phenomena
Crystallography
Chemistry Techniques, Analytical
Crystallography
Chemistry, Physical
Molecular Docking Simulation
Computer Simulation
Molecular Dynamics Simulation
Computer Simulation
Phosphatidylcholines
Glycerophospholipids
Proteolysis
Metabolism
Molecular Docking Simulation
Models, Molecular
Molecular Dynamics Simulation
Models, Molecular
Molecular Dynamics Simulation
Molecular Structure

Dati Generali

Partecipanti

EBERINI IVANO   Partecipante  

Tipo

PUR20062008 - PUR 2006-2008

Periodo di attività

Giugno 6, 2006 - Ottobre 31, 2007

Durata progetto

17 mesi
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