Il progetto proposto si inserisce nell'ambito di una ricerca più ampia volta a studiare le basi genetiche e molecolari del fenomeno dell'eterosi in mais. In particolare, da studi condotti in precedenza, sono state identificati diversi loci per caratteri quantitativi (QTL) per l'eterosi. Qui ci si propone di caratterizzare finemente due heterogeneous inbred family (HIF), che corrispondono a due QTL, uno sul cromosoma 3, e l¿altro sul cromosoma 4. Questi due QTL sono stati scelti in base al livello elevato di dominanza stimato. Nel 2007 per ciascuna HIF saranno cresciute circa 2000 piante, ciascuna delle quali sarà misurata per i caratteri che hanno manifestato eterosi nelle analisi precedenti. Inoltre, ogni pianta sarà genotipizzata utilizzando i marcatori fiancheggianti ciascun QTL. Tale genotipizzazione consentirà di identificare piante omozigoti per entrambi gli alleli fiancheggianti il QTL e piante eterozigoti e vari ricombinanti. Il confronto tra il valore medio dei due tipi di omozigoti (parentale 1 e parentale 2) con il valore medio degli eterozigoti consentirà una stima dell¿effetto di dominanza del QTL. Il DNA genomico sarà utilizzato per la mappatura fine dei QTL. Infatti l¿associazione tra i valori fenotipici e la caratterizzazione genotipica produrrà un¿ulterriore mappa genetica per i QTL considerati. La dimensione di queste popolazioni potrà portare ad una mappatura più precisa dei QTL. Sfruttando la disponibilità di mappe genetiche di concatenazione dense di mais e delle altre risorse genetiche disponibili pubblicamente, si provvederà ad arricchire le regioni dei QTL con ulteriori marcatori.
In seguito ai risultati ottenuti, i marcatori genetici in stretta concatenazione con i QTL considerati saranno usati per ancorare questa porzione della mappa genetica alla mappa fisica. In questo momento è difficile prevedere il livello di precisione che si potrà raggiungere nelle diverse regioni di interesse, soprattutto perché i dati genomici resi disponibili dalla comunità internazionale aumentano molto velocemente per Zea mays, sia in termini di assemblaggio di contigui, sia di sequenze di estremità BAC e di interi BAC, ecc. Riteniamo comunque di essere in grado di circoscrivere le maggior due regioni contenenti i QTL di interesse a singoli contigui di cloni BAC.