Caratterizzazione molecolare genome-wide di un modello di progressione tumorale renale "in vitro" mediante microarray e metodologie quantitative real time PCR
Progetto Nell'ambito di un progetto di ricerca per l'identificazione di marcatori tumorali sono state messe a punto colture cellulari primarie umane ottenute a partire da tessuto corticale e tumorale. Il materiale di partenza è costituito da tessuto proveniente da resezione chirurgica del tumore infiltrante il rene in pazienti con diagnosi di carcinoma renale (RCC). Il progetto si avvale della collaborazione con gli urologi del Ospedale Maggiore Policlinico di Milano, l¿anatomia patologica dell¿Ospedale San Paolo e il Laboratorio del prof. Roberto Perego dell¿Università di Milano Bicocca. Il materiale tumorale d¿origine è spesso eterogeneo e di bassa quantità bassa,di conseguenza è importante mettere a punto modelli cellulari primari che permettano di caratterizzare il tumore e studiarne o sviluppo alla sua origine. Ai fini dello studio dello sviluppo e della progressione tumorale è necessario caratterizzare se i modelli tumorali in vitro rappresentino un buon modello di tumore.
Per tale finalità si programma di studiare il profilo trascrizionale e genomico a diversi passaggi della colture primarie sia tumorali che di tessuto sano ( corticale renale) mediante microarray ad alta densità e analisi quantitative mediante real time PCR , parallelamente verrà effettuata la caratterizzazione cellulare delle linee. Il gruppo di ricerca è caratterizzato da una notevole esperienza nell'utilizzo delle tecnologie molecolare complesse. Nel corso dello studio verranno caratterizzati anche i processi metabolici attivati durante la progressione tumorale qiundi verranno utilizzate colture primarie ottenute da tumori renali a diverso stadiazione e a diversi passaggi di coltura. All¿analisi transcrizionale e genomica si aggiungerà una complessa analisi bionformatica e di validazione biologica.