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  1. Attività

Predizione e analisi di microRNA in Dirofilaria immitis

Progetto
I microRNA (miRNA) sono RNA eucariotici di piccola dimensione (21-23 nucleotidi) non codificanti, che costituiscono una larga classe di riboregolatori di espressione, conservata dal punto di vista evoluzionistico. I miRNA rappresentano, secondo le valutazioni più recenti, circa l¿1-5% dei geni, e nell'uomo potrebbero regolare almeno il 30% dell¿espressione del genoma tramite appaiamento nucleotidico con mRNA target. I miRNA sono coinvolti nella regolazione di molti processi cellulari fisiologici (embriogenesi, differenziamento cellulare, apoptosi, ecc.); la loro delezione, overespressione o downregolazione può essere alla base, o costituire un marker, di una determinata situazione patologica, e inoltre possono costituire bersaglio di terapia specifica ai fini di regolazione di espressione. Generalmente i miRNA sono trascritti da regioni del genoma distinte da quelle annotate come protein-coding, oppure sono localizzati in introni di sequenze codificanti, oppure in trascritti antisenso (esoni o introni) di sequenze codificanti. Il presente progetto si propone di realizzare un¿iniziale caratterizzazione della popolazione di miRNA di Dirofilaria immitis mediante studio del pattern di espressione in diversi tessuti/organi dell'adulto; l¿identificazione di miRNA ignoti verrà operata mediante predizione bioinformatica con appositi programmi che rilevano le potenziali strutture dei relativi precursori (pri-miRNA originati da lunghi trascritti spesso policistronici, pre-miRNA di circa 70 nucleotidi) sulla base di sequenze geniche disponibili (sequenze di D. immitis, genomi completi di Caenorhabditis elegans e di Brugia malayi, nematode filaride filogeneticamente molto vicino a D. immitis). La caratterizzazione strutturale dei miRNA così predetti verrà effettuata mediante gel size-separation e sequenziamento, diretto o preceduto da retrotrascrizione e clonaggio. Il pattern di espressione sarà determinato mediante TaqMan Real Time PCR
  • Dati Generali

Dati Generali

Partecipanti

MORTARINO MICHELE   Responsabile scientifico  

Tipo

PUR20062008 - PUR 2006-2008

Periodo di attività

Giugno 14, 2006 - Giugno 30, 2007

Durata progetto

12 mesi
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